Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd44P15379 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd44P15379 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd44P15379 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd44P15379 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd44P15379 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd44P15379 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd44P15379 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd44P15379 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms