Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmnb1P14733 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms