Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scd1P13516 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scd1P13516 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scd1P13516 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd1P13516 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd1P13516 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd1P13516 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scd1P13516 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms