Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vpreb2P13373 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms