Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms