Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NclP09405 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NclP09405 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NclP09405 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NclP09405 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NclP09405 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NclP09405 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NclP09405 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NclP09405 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NclP09405 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NclP09405 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NclP09405 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NclP09405 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NclP09405 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NclP09405 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NclP09405 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NclP09405 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NclP09405 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NclP09405 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NclP09405 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NclP09405 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NclP09405 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NclP09405 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NclP09405 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NclP09405 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NclP09405 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NclP09405 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NclP09405 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NclP09405 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NclP09405 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NclP09405 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NclP09405 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NclP09405 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NclP09405 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NclP09405 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NclP09405 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NclP09405 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NclP09405 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NclP09405 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NclP09405 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NclP09405 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NclP09405 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NclP09405 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NclP09405 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NclP09405 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NclP09405 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NclP09405 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NclP09405 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NclP09405 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NclP09405 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NclP09405 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NclP09405 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NclP09405 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NclP09405 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NclP09405 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NclP09405 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NclP09405 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NclP09405 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NclP09405 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NclP09405 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NclP09405 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NclP09405 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NclP09405 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NclP09405 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NclP09405 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NclP09405 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NclP09405 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NclP09405 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NclP09405 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NclP09405 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NclP09405 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NclP09405 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NclP09405 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NclP09405 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NclP09405 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NclP09405 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NclP09405 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NclP09405 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NclP09405 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NclP09405 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NclP09405 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NclP09405 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NclP09405 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NclP09405 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NclP09405 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NclP09405 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NclP09405 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NclP09405 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NclP09405 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NclP09405 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NclP09405 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NclP09405 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NclP09405 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NclP09405 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NclP09405 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NclP09405 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NclP09405 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NclP09405 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NclP09405 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NclP09405 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms