Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spta1P08032 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spta1P08032 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spta1P08032 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spta1P08032 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Spta1P08032 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spta1P08032 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spta1P08032 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spta1P08032 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spta1P08032 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Spta1P08032 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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