Protein–RNA interactions for Protein: P07744

Krt4, Keratin, type II cytoskeletal 4, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt4P07744 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt4P07744 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt4P07744 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt4P07744 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt4P07744 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt4P07744 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt4P07744 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt4P07744 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt4P07744 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt4P07744 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms