Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrygdP04342 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrygdP04342 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrygdP04342 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrygdP04342 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
CrygdP04342 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrygdP04342 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrygdP04342 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrygdP04342 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrygdP04342 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms