Protein–RNA interactions for Protein: P01823

Ig heavy chain V region 36-60, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01823 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01823 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01823 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01823 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01823 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01823 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01823 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01823 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01823 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01823 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01823 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01823 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01823 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01823 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01823 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01823 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01823 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01823 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01823 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01823 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01823 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01823 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01823 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01823 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01823 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01823 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01823 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01823 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01823 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01823 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01823 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01823 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01823 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01823 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01823 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01823 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01823 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01823 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01823 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01823 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P01823 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P01823 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P01823 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P01823 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P01823 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P01823 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P01823 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P01823 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P01823 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P01823 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P01823 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P01823 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P01823 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P01823 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P01823 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P01823 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P01823 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P01823 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P01823 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P01823 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
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