Protein–RNA interactions for Protein: P01671

Ig kappa chain V-III region PC 7175, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01671 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01671 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01671 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01671 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01671 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01671 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01671 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01671 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01671 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01671 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01671 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01671 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01671 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01671 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01671 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01671 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01671 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01671 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01671 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01671 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01671 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01671 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01671 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01671 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01671 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01671 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01671 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01671 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01671 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01671 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01671 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01671 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01671 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01671 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01671 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01671 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01671 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01671 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01671 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01671 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01671 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01671 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01671 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01671 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01671 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01671 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01671 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01671 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01671 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01671 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01671 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01671 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01671 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01671 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01671 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01671 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01671 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01671 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01671 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01671 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01671 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01671 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01671 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01671 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01671 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01671 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01671 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01671 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01671 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01671 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01671 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01671 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01671 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01671 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01671 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01671 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01671 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01671 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01671 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01671 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01671 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01671 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01671 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01671 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01671 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01671 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01671 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01671 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01671 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01671 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01671 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01671 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01671 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01671 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01671 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01671 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01671 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01671 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01671 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01671 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms