Protein–RNA interactions for Protein: P01653

Ig kappa chain V-V region W3082, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01653 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01653 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01653 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01653 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01653 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01653 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01653 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01653 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01653 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01653 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01653 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01653 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01653 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01653 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01653 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01653 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01653 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01653 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01653 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01653 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01653 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01653 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01653 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01653 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01653 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01653 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01653 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01653 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01653 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01653 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01653 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01653 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01653 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01653 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01653 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01653 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01653 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01653 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01653 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01653 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01653 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01653 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01653 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01653 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01653 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01653 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01653 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01653 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01653 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01653 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01653 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01653 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01653 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01653 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01653 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01653 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01653 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01653 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01653 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01653 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01653 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01653 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01653 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01653 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01653 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01653 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01653 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01653 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01653 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01653 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01653 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01653 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01653 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01653 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01653 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01653 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01653 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01653 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01653 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01653 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01653 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01653 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01653 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01653 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01653 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01653 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01653 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01653 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01653 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01653 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01653 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01653 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01653 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01653 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01653 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01653 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01653 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01653 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01653 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01653 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms