Protein–RNA interactions for Protein: P01644

Ig kappa chain V-V region HP R16.7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01644 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01644 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01644 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01644 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01644 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01644 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01644 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01644 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01644 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01644 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01644 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01644 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01644 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01644 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01644 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01644 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01644 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01644 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01644 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01644 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01644 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01644 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01644 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01644 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01644 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01644 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01644 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01644 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01644 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01644 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01644 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01644 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01644 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01644 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01644 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01644 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01644 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01644 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01644 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01644 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01644 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01644 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01644 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01644 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01644 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01644 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01644 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01644 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01644 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01644 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01644 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01644 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01644 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01644 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01644 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01644 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01644 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01644 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01644 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01644 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01644 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01644 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01644 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01644 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01644 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01644 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01644 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01644 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01644 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01644 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01644 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01644 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01644 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01644 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01644 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01644 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01644 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01644 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01644 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01644 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01644 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01644 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01644 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01644 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01644 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01644 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01644 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01644 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01644 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01644 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01644 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01644 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01644 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01644 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01644 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01644 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01644 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01644 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01644 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01644 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms