Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp1O89090 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp1O89090 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp1O89090 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp1O89090 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp1O89090 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp1O89090 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp1O89090 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp1O89090 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp1O89090 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms