Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm10509O88255 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm10509O88255 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm10509O88255 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm10509O88255 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm10509O88255 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm10509O88255 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm10509O88255 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm10509O88255 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm10509O88255 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm10509O88255 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm10509O88255 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm10509O88255 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm10509O88255 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm10509O88255 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm10509O88255 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm10509O88255 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm10509O88255 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm10509O88255 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm10509O88255 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm10509O88255 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm10509O88255 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm10509O88255 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm10509O88255 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm10509O88255 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm10509O88255 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm10509O88255 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm10509O88255 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm10509O88255 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm10509O88255 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm10509O88255 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Gm10509O88255 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm10509O88255 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm10509O88255 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm10509O88255 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm10509O88255 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm10509O88255 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm10509O88255 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm10509O88255 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm10509O88255 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm10509O88255 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm10509O88255 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm10509O88255 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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