Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp4O70480 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp4O70480 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms