Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms