Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PrxO55103 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PrxO55103 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PrxO55103 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrxO55103 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrxO55103 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrxO55103 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrxO55103 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrxO55103 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrxO55103 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrxO55103 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrxO55103 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrxO55103 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrxO55103 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrxO55103 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrxO55103 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrxO55103 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrxO55103 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PrxO55103 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PrxO55103 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrxO55103 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrxO55103 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrxO55103 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrxO55103 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrxO55103 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrxO55103 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrxO55103 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrxO55103 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrxO55103 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrxO55103 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrxO55103 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrxO55103 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrxO55103 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrxO55103 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PrxO55103 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrxO55103 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PrxO55103 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrxO55103 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrxO55103 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrxO55103 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrxO55103 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrxO55103 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrxO55103 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrxO55103 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrxO55103 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrxO55103 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrxO55103 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrxO55103 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrxO55103 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrxO55103 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrxO55103 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrxO55103 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrxO55103 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrxO55103 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrxO55103 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrxO55103 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrxO55103 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrxO55103 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrxO55103 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrxO55103 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrxO55103 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrxO55103 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrxO55103 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrxO55103 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrxO55103 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrxO55103 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrxO55103 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrxO55103 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrxO55103 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrxO55103 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrxO55103 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PrxO55103 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PrxO55103 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PrxO55103 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PrxO55103 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrxO55103 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrxO55103 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrxO55103 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrxO55103 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrxO55103 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrxO55103 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrxO55103 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrxO55103 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrxO55103 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrxO55103 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PrxO55103 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrxO55103 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrxO55103 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrxO55103 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrxO55103 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrxO55103 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrxO55103 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrxO55103 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrxO55103 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrxO55103 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrxO55103 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrxO55103 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrxO55103 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrxO55103 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrxO55103 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms