Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Rdh16O54909 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Rdh16O54909 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Rdh16O54909 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Rdh16O54909 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Rdh16O54909 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Rdh16O54909 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Rdh16O54909 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Rdh16O54909 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Rdh16O54909 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Rdh16O54909 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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