Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffaO54786 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffaO54786 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffaO54786 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffaO54786 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffaO54786 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffaO54786 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffaO54786 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DffaO54786 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DffaO54786 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DffaO54786 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DffaO54786 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DffaO54786 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DffaO54786 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DffaO54786 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DffaO54786 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DffaO54786 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DffaO54786 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DffaO54786 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DffaO54786 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DffaO54786 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DffaO54786 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DffaO54786 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DffaO54786 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DffaO54786 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DffaO54786 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DffaO54786 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DffaO54786 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DffaO54786 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DffaO54786 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DffaO54786 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DffaO54786 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DffaO54786 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DffaO54786 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DffaO54786 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DffaO54786 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DffaO54786 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DffaO54786 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DffaO54786 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DffaO54786 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DffaO54786 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DffaO54786 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DffaO54786 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DffaO54786 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DffaO54786 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DffaO54786 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DffaO54786 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DffaO54786 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DffaO54786 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DffaO54786 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DffaO54786 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DffaO54786 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DffaO54786 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DffaO54786 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DffaO54786 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DffaO54786 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DffaO54786 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DffaO54786 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DffaO54786 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DffaO54786 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DffaO54786 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DffaO54786 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DffaO54786 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DffaO54786 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DffaO54786 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DffaO54786 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DffaO54786 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DffaO54786 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DffaO54786 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DffaO54786 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DffaO54786 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DffaO54786 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DffaO54786 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DffaO54786 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DffaO54786 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DffaO54786 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffaO54786 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffaO54786 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffaO54786 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffaO54786 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffaO54786 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffaO54786 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms