Protein–RNA interactions for Protein: O35902

Dsg3, Desmoglein-3, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg3O35902 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg3O35902 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms