Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phox2bO35690 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms