Protein–RNA interactions for Protein: O35492

Clk3, Dual specificity protein kinase CLK3, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk3O35492 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk3O35492 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk3O35492 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk3O35492 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk3O35492 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk3O35492 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk3O35492 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk3O35492 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk3O35492 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms