Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clk2O35491 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clk2O35491 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Clk2O35491 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clk2O35491 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Clk2O35491 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Clk2O35491 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Clk2O35491 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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Clk2O35491 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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Clk2O35491 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clk2O35491 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms