Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Abcc1O35379 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcc1O35379 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcc1O35379 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcc1O35379 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcc1O35379 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcc1O35379 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcc1O35379 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcc1O35379 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcc1O35379 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcc1O35379 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcc1O35379 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms