Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

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Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ColqO35348 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ColqO35348 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ColqO35348 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ColqO35348 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ColqO35348 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ColqO35348 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ColqO35348 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ColqO35348 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ColqO35348 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ColqO35348 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ColqO35348 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ColqO35348 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ColqO35348 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ColqO35348 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ColqO35348 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ColqO35348 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ColqO35348 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ColqO35348 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ColqO35348 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ColqO35348 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ColqO35348 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ColqO35348 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ColqO35348 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ColqO35348 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ColqO35348 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ColqO35348 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ColqO35348 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ColqO35348 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ColqO35348 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ColqO35348 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ColqO35348 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ColqO35348 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ColqO35348 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ColqO35348 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ColqO35348 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ColqO35348 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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ColqO35348 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ColqO35348 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ColqO35348 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ColqO35348 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ColqO35348 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ColqO35348 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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ColqO35348 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ColqO35348 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ColqO35348 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ColqO35348 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ColqO35348 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ColqO35348 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ColqO35348 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ColqO35348 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ColqO35348 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ColqO35348 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ColqO35348 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ColqO35348 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ColqO35348 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ColqO35348 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ColqO35348 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ColqO35348 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ColqO35348 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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ColqO35348 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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ColqO35348 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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ColqO35348 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ColqO35348 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ColqO35348 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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ColqO35348 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ColqO35348 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ColqO35348 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ColqO35348 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ColqO35348 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ColqO35348 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ColqO35348 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ColqO35348 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ColqO35348 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ColqO35348 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ColqO35348 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ColqO35348 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ColqO35348 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ColqO35348 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ColqO35348 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ColqO35348 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ColqO35348 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ColqO35348 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ColqO35348 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ColqO35348 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ColqO35348 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ColqO35348 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ColqO35348 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ColqO35348 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ColqO35348 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms