Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad6O35182 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad6O35182 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad6O35182 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad6O35182 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Smad6O35182 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad6O35182 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Smad6O35182 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Smad6O35182 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Smad6O35182 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Smad6O35182 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Smad6O35182 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Smad6O35182 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad6O35182 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad6O35182 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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