Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd9O35177 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd9O35177 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd9O35177 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd9O35177 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd9O35177 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd9O35177 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd9O35177 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd9O35177 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd9O35177 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd9O35177 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd9O35177 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd9O35177 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd9O35177 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Nedd9O35177 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Nedd9O35177 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Nedd9O35177 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Nedd9O35177 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Nedd9O35177 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Nedd9O35177 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Nedd9O35177 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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