Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scarb2O35114 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scarb2O35114 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scarb2O35114 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scarb2O35114 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scarb2O35114 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scarb2O35114 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scarb2O35114 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scarb2O35114 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scarb2O35114 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scarb2O35114 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scarb2O35114 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scarb2O35114 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scarb2O35114 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scarb2O35114 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scarb2O35114 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scarb2O35114 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scarb2O35114 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scarb2O35114 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scarb2O35114 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scarb2O35114 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scarb2O35114 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Scarb2O35114 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Scarb2O35114 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Scarb2O35114 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Scarb2O35114 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Scarb2O35114 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Scarb2O35114 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Scarb2O35114 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms