Protein–RNA interactions for Protein: O35074

Ptgis, Prostacyclin synthase, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgisO35074 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtgisO35074 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgisO35074 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgisO35074 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgisO35074 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtgisO35074 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtgisO35074 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtgisO35074 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtgisO35074 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtgisO35074 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgisO35074 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgisO35074 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtgisO35074 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtgisO35074 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PtgisO35074 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms