Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NumblO08919 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NumblO08919 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NumblO08919 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NumblO08919 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NumblO08919 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NumblO08919 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NumblO08919 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NumblO08919 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NumblO08919 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NumblO08919 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NumblO08919 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NumblO08919 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NumblO08919 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NumblO08919 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NumblO08919 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NumblO08919 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NumblO08919 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NumblO08919 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NumblO08919 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NumblO08919 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NumblO08919 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NumblO08919 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NumblO08919 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NumblO08919 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NumblO08919 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NumblO08919 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NumblO08919 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NumblO08919 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NumblO08919 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NumblO08919 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NumblO08919 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NumblO08919 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NumblO08919 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NumblO08919 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NumblO08919 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NumblO08919 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NumblO08919 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NumblO08919 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NumblO08919 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NumblO08919 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NumblO08919 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NumblO08919 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NumblO08919 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NumblO08919 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NumblO08919 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NumblO08919 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NumblO08919 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NumblO08919 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NumblO08919 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NumblO08919 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NumblO08919 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NumblO08919 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NumblO08919 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NumblO08919 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NumblO08919 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NumblO08919 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NumblO08919 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NumblO08919 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NumblO08919 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NumblO08919 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NumblO08919 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NumblO08919 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NumblO08919 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NumblO08919 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NumblO08919 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NumblO08919 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NumblO08919 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NumblO08919 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NumblO08919 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NumblO08919 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NumblO08919 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NumblO08919 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NumblO08919 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NumblO08919 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NumblO08919 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NumblO08919 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NumblO08919 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NumblO08919 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NumblO08919 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NumblO08919 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NumblO08919 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NumblO08919 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NumblO08919 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NumblO08919 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NumblO08919 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NumblO08919 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NumblO08919 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NumblO08919 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NumblO08919 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NumblO08919 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NumblO08919 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NumblO08919 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NumblO08919 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NumblO08919 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NumblO08919 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NumblO08919 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NumblO08919 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NumblO08919 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NumblO08919 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms