Protein–RNA interactions for Protein: O08583

Alyref, THO complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlyrefO08583 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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