Protein–RNA interactions for Protein: L7N1W8

Vmn2r88, Vomeronasal 2, receptor 88, mousemouse

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Length 857 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r88L7N1W8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Vmn2r88L7N1W8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn2r88L7N1W8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn2r88L7N1W8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn2r88L7N1W8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn2r88L7N1W8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn2r88L7N1W8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn2r88L7N1W8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn2r88L7N1W8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn2r88L7N1W8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn2r88L7N1W8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn2r88L7N1W8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn2r88L7N1W8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn2r88L7N1W8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn2r88L7N1W8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn2r88L7N1W8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Vmn2r88L7N1W8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn2r88L7N1W8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn2r88L7N1W8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Vmn2r88L7N1W8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Vmn2r88L7N1W8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Vmn2r88L7N1W8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn2r88L7N1W8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn2r88L7N1W8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn2r88L7N1W8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Vmn2r88L7N1W8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Vmn2r88L7N1W8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn2r88L7N1W8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r88L7N1W8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Vmn2r88L7N1W8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r88L7N1W8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Vmn2r88L7N1W8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r88L7N1W8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r88L7N1W8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r88L7N1W8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r88L7N1W8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Vmn2r88L7N1W8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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