Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms