Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Gm3415J3QMS8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3415J3QMS8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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