Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms