Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21411J3KMS0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms