Protein–RNA interactions for Protein: H3BK29

Vmn2r6, Vomeronasal 2, receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r6H3BK29 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn2r6H3BK29 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn2r6H3BK29 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn2r6H3BK29 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn2r6H3BK29 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn2r6H3BK29 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn2r6H3BK29 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn2r6H3BK29 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn2r6H3BK29 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn2r6H3BK29 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn2r6H3BK29 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn2r6H3BK29 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn2r6H3BK29 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn2r6H3BK29 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Vmn2r6H3BK29 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Vmn2r6H3BK29 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Vmn2r6H3BK29 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn2r6H3BK29 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn2r6H3BK29 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn2r6H3BK29 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn2r6H3BK29 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn2r6H3BK29 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn2r6H3BK29 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn2r6H3BK29 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn2r6H3BK29 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Vmn2r6H3BK29 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn2r6H3BK29 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn2r6H3BK29 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn2r6H3BK29 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn2r6H3BK29 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn2r6H3BK29 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn2r6H3BK29 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn2r6H3BK29 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Vmn2r6H3BK29 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn2r6H3BK29 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn2r6H3BK29 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Vmn2r6H3BK29 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Vmn2r6H3BK29 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Vmn2r6H3BK29 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Vmn2r6H3BK29 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Vmn2r6H3BK29 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Vmn2r6H3BK29 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Vmn2r6H3BK29 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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