Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H2-M1F7CXU4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms