Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Igkv1-99F6XWB2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms