Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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