Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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