Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

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Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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Herc6F2Z461 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Herc6F2Z461 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Herc6F2Z461 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Herc6F2Z461 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Herc6F2Z461 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Herc6F2Z461 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Herc6F2Z461 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Herc6F2Z461 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Herc6F2Z461 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Herc6F2Z461 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Herc6F2Z461 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc6F2Z461 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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