Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmod3E9QA62 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms