Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC005561E9Q5E2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms