Protein–RNA interactions for Protein: E9Q309

Cep350, Centrosome-associated protein 350, mousemouse

Predictions only

Length 3,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep350E9Q309 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Cep350E9Q309 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cep350E9Q309 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep350E9Q309 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep350E9Q309 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep350E9Q309 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep350E9Q309 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep350E9Q309 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep350E9Q309 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep350E9Q309 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep350E9Q309 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep350E9Q309 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep350E9Q309 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep350E9Q309 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep350E9Q309 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep350E9Q309 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep350E9Q309 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep350E9Q309 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep350E9Q309 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep350E9Q309 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep350E9Q309 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep350E9Q309 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep350E9Q309 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep350E9Q309 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep350E9Q309 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep350E9Q309 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep350E9Q309 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep350E9Q309 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep350E9Q309 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms