Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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