Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms