Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt78E9Q0F0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms