Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Scaf11E9PZM7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scaf11E9PZM7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scaf11E9PZM7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scaf11E9PZM7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scaf11E9PZM7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scaf11E9PZM7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scaf11E9PZM7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scaf11E9PZM7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scaf11E9PZM7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scaf11E9PZM7 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scaf11E9PZM7 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scaf11E9PZM7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scaf11E9PZM7 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scaf11E9PZM7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scaf11E9PZM7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scaf11E9PZM7 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Scaf11E9PZM7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scaf11E9PZM7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scaf11E9PZM7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scaf11E9PZM7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scaf11E9PZM7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scaf11E9PZM7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scaf11E9PZM7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scaf11E9PZM7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scaf11E9PZM7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scaf11E9PZM7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scaf11E9PZM7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scaf11E9PZM7 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scaf11E9PZM7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scaf11E9PZM7 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scaf11E9PZM7 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scaf11E9PZM7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scaf11E9PZM7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scaf11E9PZM7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms